Każdy system CMS, wyposażony jest w zaplecze, czyli miejsce, w którym zarządzający witryną dokonuje wszystkich operacji związanych z działaniem serwisu. To właśnie tam, na zapleczu, możemy dodawać i usuwać artykuły czy też newsy z naszej strony. Także na zapleczy możemy edytować i przeglądać informacje o zarejestrowanych użytkownikach naszej witryny, rozsyłać do nich mailing. Wreszcie możemy ustalać wygląd naszej strony poprzez zmianę motywów naszej strony, co jest jedną z pierwszych czynności, jaką każdy administrator systemu zarządzania treścią będzie musiał wykonać.

Najpierw oczywiście należy się zalogować na zaplecze, używając w tym celu, nazwy użytkownika i hasła, podanego przez nas podczas procesu instalacji serwisu na serwerze. W większości systemów zostaniemy od razu przeniesieni na zaplecze, które na pierwszy rzut oka może się wydawać każdemu czarną magią, jednak po chwili każdy będzie się w mniejszym lub też większym stopniu orientował, co i gdzie należy wykonywać.

Każdy system CMS jest nieco inny pod względem budowy zaplecza i dostępnych w nim opcji, nie mniej jednak, większość tych darmowych, opartych na licencji GNU GPL, wyposażona jest w paczki językowe, co pozwala nam szybko ustawić język polski, przez co całość administracji stroną staje się jeszcze prostsza. Jest to spowodowane tym, że większość z tych systemów ma charakter Open Source, co znaczy, że każdy, kto potrafi programować, może zając się dalszym rozwojem projektu. W związku z tym, na całym świecie powstają liczne grupy programistów, które tworzą paczki językowe oraz dodatkowe moduły i pluginy do systemów. To właśnie dzięki tym społecznościom programistów, skupionym wokół danego projektu, darmowe systemy CMS są bardzo rozbudowane, co zaś sprawia, że praktycznie każdy znajdzie zestaw modułów, niezbędny mu do uzyskania pożądanych efektów.